Директор – назначается и освобождается от занимаемой должности приказом председателя Комитета по образованию и молодёжной политике администрации Энгельсского муниципального района в соответствии с трудовым законодательством Российской Федерации на основании трудового договора, заключаемого на неопределённый срок. Осуществляет руководство деятельностью Учреждения в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом, несет ответственность за деятельность Учреждения.
Заместители директора – назначаются на должность директором Учреждения. Осуществляют управление учебно-методическим и воспитательным процессом в школе.
Общее собрание работников Учреждения - общее собрание обсуждает и рекомендует к утверждению проект коллективного договора, правила внутреннего трудового распорядка школы, обсуждает вопросы трудовой дисциплины в школе и мероприятия по ее укреплению, рассматривает факты нарушения трудовой дисциплины работниками школы, рассматривает вопросы охраны и безопасности условий труда работников, охраны жизни и здоровья обучающихся.
Управляющий совет - является коллегиальным органом, наделённом полномочиями по осуществлению управленческих функций в соответствии с уставом школы. Совет вносит рекомендации и предложения по вопросам материально-технического обеспечения   и оснащения образовательного процесса, создания в школе необходимых условий для организации питания, медицинского обслуживания, проведения мероприятий по охране труда и укреплению здоровья обучающихся.
Педагогический совет – является постоянно действующим органом самоуправления Учреждения, который создается для рассмотрения основных вопросов образовательного процесса, локальных актов Учреждения.
Методический совет – создан для учебно-методической поддержки методических объединений, создания условий для многоуровневой системы непрерывного педагогического образования, разработки локальных актов Учреждения, касающихся образовательной и воспитательной деятельности. 
Родительские комитеты классов – создаются в целях содействия Учреждению в осуществлении воспитания и обучения детей в Учреждении. Родительский комитет призван содействовать Учреждению в организации образовательного процесса, социальной защите обучающихся, обеспечении единства педагогических требований к обучающимся. Общешкольный родительский комитет, в состав которого входят представители классных комитетов, участвует в разработке локальных актов Учреждения.
Социально-профилактическая служба – включает совет профилактики, служба примирения, социальный педагог, психолог и уполномоченный по ЗПУОО. Целью службы является формирование законопослушного поведения и здорового образа жизни несовершеннолетних, защита их прав и интересов. В своей деятельности служба руководствуется Конвенцией ООН о правах ребёнка, Конституцией РФ, Уставом школы.
Библиотека - организует обучение навыкам независимого библиотечного пользователя и потребителя информации, содействует интеграции комплекса знаний, умений и навыков работы с книгой и информацией, оказывает информационную поддержку в решении задач, возникающих в процессе их учебной, самообразовательной и досуговой деятельности, организует массовые мероприятия, ориентированные на развитие общей и читательской культуры личности, содействует развитию критического мышления, содействует членам педагогического коллектива и администрации школы в организации образовательного процесса.
Совет обучающихся - формируется по инициативе обучающихся с целью учета мнения обучающихся по вопросам управления образовательной организацией и при принятии локальных нормативных актов, затрагивающих права и законные интересы обучающихся.
Методическое объединение классных руководителей - занимается  методическим обеспечением воспитательного процесса, исследованием его эффективности, повышения профессионального мастерства педагогов.
Методическое объединение учителей предметников - осуществляет руководство методической, инновационной, внеклассной работой по одному или нескольким учебным предметам.
Детское объединение «Город мастеров» - создано с целью развития ответственной личности, способной действовать в условиях правового государства творчески, инициативно, с пользой для себя и общества. Критерием результативности деятельности ДО является активное вовлечение учащихся в учебно-воспитательный процесс. Лидерами объединения разработано и проведено множество мероприятий по различным направлениям. За свою активную деятельность ребята имеют награды и победы различных уровней.
Все перечисленные структуры совместными усилиями решают основные задачи образовательного учреждения и соответствуют Уставу школы.
Управление Учреждением строится на принципах единоначалия и самоуправления.
Основные формы координации управления образовательным учреждением:
- совещание при директоре;
- совещание при заместителе директора;
- педагогический совет;
- общее собрание трудового коллектива; 
- методический совет;
- родительский комитет;
- совет обучающихся.